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Tutorial de técnicas de análisis de secuencias biológicas.





Proyectos Genoma de diversos organismos

En esta sección presentamos los enlaces a las páginas web de diversos proyectos de secuenciamiento de genomas de algunos, organismos por orden alfabético, con los nombres y ubicación de las diversas instituciones a cargo de ellos.

Como resultado secundario del proyecto Genoma Humano, coordinado por el Departamento de Energía de los Estados Unidos, se han empezado a desarrollar y en algunos casos completar, los genomas de algunos organismos bien sea por intereses comerciales, de investigación o ambos.

Algunos de estos organismos ya han sido totalmente secuenciados y caracterizados.

Los proyectos a que aquí se presentan tienes muy distintos estadios de desarrollo. En algunos casos se han completado las secuencias del genoma de todo el organismo, en otros casos están apenas en sus inicios. Dado que cada uno de los proyectos esta siendo llevado adelante por muy distintas instituciones a nivel mundial, también se deben esperar muy diversos niveles de calidad en los servicios prestados.

Los URL que se señalan, están en permanente actualización por parte de sus autores, por lo cual le agradecemos reportar cualquier problema de conexión a alejo@ciens.ula.ve

Aedes spp. y Anopheles sp. Varias especies de mosquitos.

Mosquito Genomics
Department of Bioagricultural Sciences and Pest Management, Colorado State University, USA.

Arabidopsis thaliana
MIPS, Martinsread for Protein Sequences
Max Planck Institute for Biochemistry, Alemania

Bacillus subtilis
NRSub (Non-Redundant Database for Bacillus subtilis)
Japón y Francia

Borrelia burgdorferi
The Borrelia burgdorferi sensu lato Molecular Genetics Server
Institut Pasteur, Francia.

Bos bovis Genoma de la vaca.
Cattle Genome Mapping Project
United States Department of Agriculture, USA

Caenorhabditis elegans
Sanger Center y Genome Sequencing Center
UK y Washington University School of Medicine, USA

Candida albicans
Alces WWW Server
University of Minnesota, USA

Canis canis Genoma del Perro.
Dog Genome Project
University of California, University of Oregon, y el Fred Hutchinson Cancer Research Center, USA.

Danio rerio. Genoma del Pez Cebra
The fish net
Institute of Neuroscience de la University of Oregon, USA.

Drosophila spp. Mosca de la fruta.
FlyBase, Drosophila Genomic Database,
U.S. National Institutes of Health y el British Medical Research Council.

Escherichia coli
E. coli Genome Center
University of Wisconsin, USA.
Información general acerca de E. coli, en la University of Birmingham, UK.

Gallus gallus Genoma de la Gallina.
Chicken Genome Mapping Project.
Roslin Institute, UK

Haemophilus influenzae
The Haemophilus influenzae Rd Genome Database (HIDB)
TIGR, The Institute for Genomic Research, USA.

Human Genome Program
U.S. Department of Energy, USA
Sistema de Información del Proyecto Genoma Humano. .

The Methanococcus jannaschii Genome Database (MJDB)
The Methanococcus jannaschii Genome Database (MJDB)
TIGR, The Institute for Genomic Research, USA.

Microbial genome program
U.S. Department of Energy (DOE)
El Departamento de Energía, además del programa Genoma Humano, coordina una iniciativa multiinstitucional de genomas microbianos.

Mus musculus (mouse)
Genetic and Physical Maps of the Mouse Genome
Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, USA.

Mycobacterium leprae
Mycobacterium leprae Sequence Data
Genome Therapeutics Corporation, USA

Mycobacterium tuberculosis
The Sanger Centre, UK

Mycobacterium spp.
The Integrated Mycobacterial Database
World Health Organization, Fondation Raoul Follereau, Unite de Genetique Moleculaire Bacterienne del Institut Pasteur, France; Department of Biochemistry de The Royal Institute of Technology, Suecia.

Mycoplasma genitalium
The Mycoplasma genitalium Genome Database (MGDB)
TIGR, The Institute for Genomic Research, USA.

Mycoplasma capricolum
Infomatrix home page
Harvard Genome Lab y George Mason University, USA.

Organelle genomes. Genomas de Organelas.
OGMP, Organelle Genome Megasequencing Program y GOBASE, Organelle Genome Database
University of Montreal, Canada.

Oryza sativa (rice)
Rice Genome Research Program
STAFF Institute, Tsukuba, Japan

Parasite Genome Initiatives
Leishmania Genome Project
Fundação Tropical de Pesquisas e Tecnologia "André Tosello"; Base de Dados Tropical, Brasil.

Phaseolus y Vigna Genomas de guisantes.
BeanRef
University of Kaiserslautern, Germany

Plant and Livestock Genomes. Genomas de especies agropecuarias.
Genome Informatics Group
Databases at the National Agricultural Library, USA.

Plasmodium falciparum
Malaria database
The Department of Microbiology, Monash University y el The Walter and Eliza Hall Institute of Medical Research, Australia.

Rat Genoma de la rata
Ratmap WWW Server
Göteborg University

Saccharomyces cerevisiae
MIPS, Martinsread for Protein Sequences
Max Planck Institute for Biochemistry, Alemania

Schizosaccharomyces pombe
Schizosaccharomyces pombe Sequencing Projects
Sanger Centre, UK y el Cold Spring Harbour Laboratory, USA.

Sulfolobus solfataricus
The Sulfolobus solfataricus Genome Project
National Research Council, Canada

Sus scrofa Genoma de porcinos.
Swine Genome Mapping Project
Agricultural Research Services, USA

Synechocystis sp.
CyanoBase. The Genome Database for Synechocystis sp. Strain PCC 6803
Kazusa DNA Research Institute, Japón

Treponema pallidum
Treponema pallidum Molecular Genetics Server
University of Texas Medical School-Houston, USA

Trypanosoma brucei and Trypanosoma cruzi
Trypanosoma brucei Genome Project
World Health Organisation., UK.

Zea mays Maiz
Maize Genome Database: MaizeDB
University of Missouri, Columbia, USA




Otros Organismos cuyos genomas están empezando a ser secuenciados:

Archaeoglobus fulgidus
Clostridium acetobutylicum
Deinococcus radiodurans
Helicobacter pylori
Methanobacterium thermoautotrophicum
Mycoplasma pneumoniae
Pseudomonas aeruginosa
Pyrobaculum aerophilum
Pyrococcus furiosus
Rickettsia prowazekii
Rickettsia rickettsii
Rhodobacter capsulatus
Rhodobacter sphaeroides
Staphylococcus aureus
Ureaplasma urealyticum
Vibrio cholerae





Otros Índices.
Existen otros índices en Internet de proyectos genoma.

Genome Centres Menu
Human Genome Mapping Project
Medical Research Council
, UK.
Clasificado por centros de investigación.

Genome Sequencing Technologies
George M. Church Lab
Department of Genetics / HHMI
Harvard Medical School
, USA
Con una clasificación en forma de árbol, de los organismos hasta ahora estudiados, la cuantificación del avance de cada proyecto y una descripción exhaustiva de las diversas técnicas de secuenciamiento.

DOGS
Database Of Genome Sizes
Base de Datos de Tamaños de Genomas de diversos organismos, tanto ya medidos como estimados.