Los sistemas operativos utilizan diferentes códigos para almacenar la información, por lo tanto, es necesario traducir la información cuando se lleva de un sistema operativo a otro. Siempre hay que tener en cuenta que los archivos que se pueden llevar de un sistema operativo a otro son los de datos (texto, imágenes, etc) ya que los programas están escritos en un lenguaje que sólo puede ser entendido por el sistema operativo para el que fueron escritos.
La forma más eficiente de transferir archivos de un sistema operativo a otro es a través de una red. Si la transferencia se quiere hacer a través de un disquete, es necesario disponer de un software especial.
La más común de estas herramientas es el conjunto Mtools que permiten leer y escribir disquetes formateados bajo DOS en una máquina UNIX. Los comandos más comunes de las Mtools son:
| mcd | Se cambia de directorio en el disquete |
| mdir | Muestra el directorio actual en el disquete |
| mcopy | Copia un archivo de unix a DOS o viceversa |
| mdel | Borra un archivo en el disquete |
| mmd | Crea un directorio en el disquete |
| mrd | Borra un directorio en el disquete |
Estos comandos se utilizan con una sintaxis similar a la del MS-DOS.